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除了增加检测通量之外，二代测序（NGS）还可用于研究病毒基因组。研究病毒基因组中的微小变异将有助于探明病毒的来源。

如果用二代测序（NGS）代替 RT-qPCR，则可以提高病毒检测的通量。

在SARS-CoV-2-研究和疫苗开发中，必须对病毒进行安全检测。当前的最高标准涉及纯化病毒基因组材料，然后进行逆转录定量PCR（RT-qPCR）。

通常通过血清学测试来检查是否存在 SARS-CoV-2 抗体。即使已无症状，检测出特异性抗体也表明过去曾感染过病原体

世界卫生组织目前在全球列出170多个项目，这些项目致力于开发预防和控制 SARS-CoV-2 的疫苗。开发新疫苗具有挑战性，不同的方法需要使用到不同的实验室设备。